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蛋白糖基化修飾及其分析方法簡介

發(fā)布時間: 2023-12-20  點擊次數(shù): 713次

 

1.糖基化定義

糖基化是在酶的控制下,蛋白質(zhì)或脂質(zhì)附加上糖類的過程,發(fā)生于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體等部位。在糖基轉(zhuǎn)移酶作用下將糖轉(zhuǎn)移至蛋白質(zhì),和蛋白質(zhì)上的氨基酸殘基共價結(jié)合。蛋白質(zhì)經(jīng)過糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是對蛋白的重要的修飾作用,有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)功能作用。糖基化的結(jié)果使不同的蛋白質(zhì)打上不同的標(biāo)記,改變多肽的構(gòu)象和增加蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性。

蛋白糖基化
蛋白糖基化
2.糖基化修飾的作用及類型

作為一種普遍存在的翻譯后修飾,蛋白質(zhì)糖基化影響蛋白的功能,在許多生物過程中起著重要的作用,如免疫保護(hù)、病毒的復(fù)制、細(xì)胞生長、細(xì)胞與細(xì)胞之間的黏附、炎癥的產(chǎn)生等。很多蛋白,如轉(zhuǎn)錄因子、熱休克蛋白、核小孔蛋白、RNA聚合酶Ⅱ、致癌基因翻譯產(chǎn)物、酶等,都發(fā)現(xiàn)了糖基化這種翻譯后修飾方式。

糖基化的作用可概括為3點:①使蛋白質(zhì)能夠抵抗消化酶的作用;②賦予蛋白質(zhì)傳導(dǎo)信號的功能;③某些蛋白只有在糖基化之后才能正確折疊。糖基一般連接在4種氨基酸上,分為兩種:N-連接的糖基化(N-linked glycosylation):與天冬酰胺殘基的NH?連接,連接的糖為N-乙酰葡糖胺;O-連接的糖基化(O-linked glycosylation):與Ser、Thr和Hyp的OH連接,連接的糖為半乳糖或N-乙酰半乳糖胺,在高爾基體上進(jìn)行O-連接的糖基化。

N-連接和O-連接的糖基化
N-連接和O-連接的糖基化
3.蛋白質(zhì)的糖基化分析

蛋白質(zhì)的糖基化分析主要包括以下幾個方面:糖基化是否發(fā)生;在哪里發(fā)生了糖基化;糖基化的類型是什么;糖鏈中各種糖的種類和含量;糖鏈的一級結(jié)構(gòu)等。應(yīng)用于糖鏈結(jié)構(gòu)解析方面的質(zhì)譜技術(shù)和核磁共振技術(shù),各種技術(shù)有其各自優(yōu)缺點,在應(yīng)用中可以互補(bǔ)。目前糖分析的研究技術(shù)主要分為兩大部分:分離富集親和技術(shù)、糖蛋白鑒定/糖基化位點確定方法。其中分離富集親和技術(shù)包括:①凝集素親和技術(shù);②肼化學(xué)富集法;③親水色譜法;④β- 消除米氏加成反應(yīng),糖蛋白鑒定 / 糖基化位點的確定方法包括:① PNGase F酶法;②Endo H酶法;③三氟甲基磺酸(trifluoromethananesulphonic acid,TFMS)法。以下著重介紹一下分析糖鏈結(jié)構(gòu)的質(zhì)譜法和核磁共振法。

(1) 質(zhì)譜法

經(jīng)典質(zhì)譜分析技術(shù)通常采用酶法或者化學(xué)的方法把糖鏈與肽鏈分開,再分別在氨基酸序列水平或者糖鏈水平進(jìn)行進(jìn)一步的分析。有研究采用膜上樣品直接質(zhì)譜分析技術(shù),這種技術(shù)需要的樣品量小,因此1個2-D膠上的蛋白質(zhì)點可以被分為若干份進(jìn)行處理,一部分用蛋白酶進(jìn)行酶解,用于蛋白質(zhì)的鑒定,另一部分用糖苷酶進(jìn)行酶解,用于寡糖鏈結(jié)構(gòu)的研究,再將這兩部分結(jié)合起來,就可以得到糖肽的信息。

(2) 核磁共振法(NMR)

目前,NMR技術(shù)已成為糖鏈立體化學(xué)結(jié)構(gòu)分析的方法之一,可確定糖鏈的構(gòu)型、連接位置、分支和微觀多樣性。Kogelberg等從人乳中分離出一種未果糖型和3種不同果糖型的寡糖。通過ES-MS和NMR的結(jié)合使用確定其結(jié)構(gòu)特點,通過ES-MS/MS分析闡明其分支類型、 血型相關(guān)劉易斯決定簇、部分序列和寡糖鏈連接情況,然后通過甲基化分析和1H-NMR確定其全序列。再鑒定出三種新的糖鏈結(jié)構(gòu):未果糖結(jié)構(gòu),單果糖結(jié)構(gòu)和三果糖結(jié)構(gòu)。但NMR測定糖的訊號峰重疊嚴(yán)重,解析較難,靈敏度不高,而且多維NMR需要毫克級樣品,這對多數(shù)糖復(fù)合物中的微量糖鏈?zhǔn)呛茈y達(dá)到的。

4.小結(jié)

蛋白質(zhì)糖基化是溝通蛋白質(zhì)和糖這二大類生物大分子的橋梁。在蛋白質(zhì)組學(xué)水平進(jìn)行蛋白質(zhì)糖基化研究有助于認(rèn)識蛋白質(zhì)糖基化發(fā)生、發(fā)展的規(guī)律及其在整個生命過程中的生物學(xué)意義,有助于從基因組-蛋白組-糖組這樣一個宏觀的綜合的層面上觀察分析生命現(xiàn)象,達(dá)到對生命現(xiàn)象更本質(zhì)的認(rèn)識,進(jìn)而有助于發(fā)病機(jī)制的闡明,為疾病的早期診斷、治療等提供指導(dǎo)。

 

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